Air permukaan saat ini banyak dimanfaatkan untuk berbagai keperluan, seperti untuk kebutuhan rumah tangga, irigasi, pembangkit listrik, industri dan sebagai penunjang kehidupan. Dengan banyaknya pemanfaatan air permukaan, tentunya kualitas air permukaan perlu diperhatikan.

Permasalahan pencemaran air permukaan sering terjadi karena karakter air permukaan yang sangat sensitif terhadap pencemaran. Pencemaran dapat berasal dari limbah industri, transportasi, tempat pembuangan sampah, kegiatan perikanan dan pertanian serta kegiatan lainnya. Laboratorium AAS dapat melakukan pengujian kualitas air permukaan dengan berbagai parameter pengujian antara lain :

1. Analisis Fisik
2. Analisis konsentrasi nutrisi
3. Analisis konsentrasi logam berat
4. Analisis konsentrasi senyawa anorganik
5. Analisis konsentrasi senyawa organik
6. Analisis mikrobiologi
7. Analisa Biota Perairan (Plankton, Bentos, Nekton)
8. Radioaktivitas (*subkont)

Dalam Peraturan Pemerintah Republik Indonesia Nomor 22 Tahun 2021 yang mengatur tentang mutu air permukaan, perlu dilakukan pengujian mutu air permukaan dengan menggunakan laboratorium penguji yang telah bersertifikat, terdaftar dan terakreditasi sesuai dengan parameter pengujian. Laboratorium AAS sebagai laboratorium penguji telah tersertifikasi ISO 17025 dan juga telah terdaftar di Kementerian Lingkungan Hidup dan Kehutanan sebagai Laboratorium Penguji.